代第三方公司与员工签订合同时，劳动关系的认定应根据具体情况区分。

《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》并未禁止他人代理劳动者本人签订劳动合同，因此代签劳动合同的法律效力不能一概而论，需要根据具体情况进行认定。

如果劳动者事前无授权但事后追认，且代签人具备完全民事行为能力，则该劳动合同能得到有效认定。

此外，即使双方未签订书面劳动合同，只要满足一定条件，也可能成立事实上的劳动关系。

然而，如果是企业将人事外包给人力资源公司，员工与外包的人力资源公司签订劳动合同，则员工属于派遣性质，不是企业的正式员工。

因此，代第三方公司与员工签订合同时，劳动关系的认定需考虑是否有授权、代签人的资格以及是否符合法律规定等因素。